מבוא לביואינפורמטיקה (0455.3066)
עודכן: 22.10.2017
שם הקורס באנגלית: Introduction to Bioinformatics
| סוג: שיעור | ||||||
| מספר קורס | סמסטר | יום | משעה | עד שעה | בניין | חדר |
| 0455.3066.01 | א | ג | 15:00 | 17:00 | בריטניה | 014 |
| 0455.3066.02 | א | ב | 10:00 | 12:00 | בריטניה | 005 |
סילבוס:
מטרת הקורס הינה שהתלמידים יכירו את המונחים הבסיסיים של התחום ואת הרעיונות המרכזיים אשר נמצאים בשימוש נרחב (לדוגמה מבוא לניתוח נתונים של מערכי גנים).
בקורס ילמדו הנושאים הבאים:
1. ביולוגיה חישובית – מהפכה במדעי החיים במאה ה 21.
2. עימוד (alignment) וחיפוש הומולוגים ע”י בלסט.
3. עימוד של מספר רב של רצפים ושימוש השוואות רצפים לביולוגיה.
4. דומיינים של חלבונים, מוטיבים, שינויים אחרי תרגום – גישה חישובית.
5. לתוך הגנום: סטטיסטיקה של גנומים, מה הגנומים מלמדים אותנו.
6. עצים פילוגנטיים ושימושם לחקר האבולוציה.
7. ניתוח ניסויי מערכי גנים (צ’יפים).
8. רשתות ביולוגיות.
9. הסקת לחצי סלקציה על חלבונים (סלקציה חיובית, ניטראלית ומטהרת).
10 למידה חישובית, קיבוץ (clustering), סיווג (classification) וכדומה.
11. גנטיקה של אוכלוסיות תוך דגש על ניתוח SNPs.
12. ניתוח תמונות תאים חיים בזמן אמת – גישה חישובית.
בקורס ילמדו הנושאים הבאים:
1. ביולוגיה חישובית – מהפכה במדעי החיים במאה ה 21.
2. עימוד (alignment) וחיפוש הומולוגים ע”י בלסט.
3. עימוד של מספר רב של רצפים ושימוש השוואות רצפים לביולוגיה.
4. דומיינים של חלבונים, מוטיבים, שינויים אחרי תרגום – גישה חישובית.
5. לתוך הגנום: סטטיסטיקה של גנומים, מה הגנומים מלמדים אותנו.
6. עצים פילוגנטיים ושימושם לחקר האבולוציה.
7. ניתוח ניסויי מערכי גנים (צ’יפים).
8. רשתות ביולוגיות.
9. הסקת לחצי סלקציה על חלבונים (סלקציה חיובית, ניטראלית ומטהרת).
10 למידה חישובית, קיבוץ (clustering), סיווג (classification) וכדומה.
11. גנטיקה של אוכלוסיות תוך דגש על ניתוח SNPs.
12. ניתוח תמונות תאים חיים בזמן אמת – גישה חישובית.
דרישות קדם: מבוא לביולוגיה א', מבוא לביולוגיה ב', מבוא לביולוגיה ג', סטטיסטיקה
נוכחות חובה
הרכב ציון:
85% בחינה
15% תרגילים
85% בחינה
15% תרגילים
מטלת סיום: בחינה בכתב
