גנטיקה של מיקרואורגניזמים ובקרת הביטוי הגנטי (0455.3682)
עודכן: 20.07.2017
שם הקורס באנגלית: Microbial Genetics
סוג: שיעור | ||||||
מספר קורס | סמסטר | יום | משעה | עד שעה | בניין | חדר |
0455.3682.01 | א | ב | 10:00 | 12:00 | בריטניה | 006 |
א | ה | 12:00 | 14:00 | בריטניה | 006 |
סילבוס:
דיונים במבנה, בפעולה ובבקרה של מנגנוני ביטוי החומר הגנטי בחיידקים, בדגש על הנושאים הבאים:
• התפתחות הגנטיקה המודרנית לבחינה רב מערכתית: מונחי הגנומיקה, טרנסקריפטומיקה ופרוטיאומיקה
• האבולוציה של גישות למיפוי גנטי בחיידקים מהעבר להווה
• שיטות מיפוי קלאסיות
• רקומבינציה כללית וספציפית כתהליכים חיוניים לשחלוף מידע גנטי
• מיפוי על-ידי קוניוגציה
• מיפוי על ידי טרנסדוקציה כללית
• מיפוי על ידי טרנסדוקציה ספציפית
• מיפוי בעזרת טרנספוזונים
• שיטות מיפוי מודרניות
• מיפוי בעזרת אנזימי רסטריקציה והיברידיזציה [המפה של Kohara)
• פרויקטי פיענוח גנומים בקטריאליים
• מבוא לשימוש ב- DNA chips לגנומיקה ולטרנסקריפטומיקה
• פלסמידים
• בקרת ההכפלה לבקרת מספר העותקים
• סגרגציה של רפליקונים
• מערכות Post segregational killing
• בקרת הביטוי הגנטי כתגובת החיידקית לשינויים סביבתיים, השימוש במוטנטים ובגישות רב-מערכתיות ללימודן, רשתות העברת סיגנלים בחיידקים
• מערכת התגובה לעקה כללית General stress response
• מערכת התגובה לנזקים ל-The SOS response DNA
• מערכת התגובה לעקת חום The heat-shock response
• מערכת התגובה להרעבה לחומצות אמיניות The stringent response
• Recoding: צורות ביטוי בלתי שגרתיות של הצופן הגנטי
• מודל האופרון בבקרת ביטוי גנים:
• בקרה חיובית ושלילית
• בקרת שיעתוק על ידי אנטי-טרמינציה
• בקרה מרחוק Action at a distance
• מתגים גנטיים
• פרוטיאוליזה כמנגנון בקרה גנטי
• פרוטיאזות תלויות-אנרגיה
• TmRNA ותפקידו בתיוג חלבונים לדגרדציה
• פרוטיאזות כשפרונים מולקולריים
• מולקולות RNA קטנות ותפקידיהם בבקרת ביטוי גנים
• בקרה חיובית ושלילית ברמת התרגום
• גילוי ואפיון מולקולות חדשות בעזרת DNA microarrys
• מערכות העברת סיגנלים
• Two component ststems
• התנהגות קבוצתית של חיידקים
• Quorum sensing in Gram positive and Gram negative bacteria
• התארגנות ”רב תאית” ויצירת ביופילמים
• התפתחות הגנטיקה המודרנית לבחינה רב מערכתית: מונחי הגנומיקה, טרנסקריפטומיקה ופרוטיאומיקה
• האבולוציה של גישות למיפוי גנטי בחיידקים מהעבר להווה
• שיטות מיפוי קלאסיות
• רקומבינציה כללית וספציפית כתהליכים חיוניים לשחלוף מידע גנטי
• מיפוי על-ידי קוניוגציה
• מיפוי על ידי טרנסדוקציה כללית
• מיפוי על ידי טרנסדוקציה ספציפית
• מיפוי בעזרת טרנספוזונים
• שיטות מיפוי מודרניות
• מיפוי בעזרת אנזימי רסטריקציה והיברידיזציה [המפה של Kohara)
• פרויקטי פיענוח גנומים בקטריאליים
• מבוא לשימוש ב- DNA chips לגנומיקה ולטרנסקריפטומיקה
• פלסמידים
• בקרת ההכפלה לבקרת מספר העותקים
• סגרגציה של רפליקונים
• מערכות Post segregational killing
• בקרת הביטוי הגנטי כתגובת החיידקית לשינויים סביבתיים, השימוש במוטנטים ובגישות רב-מערכתיות ללימודן, רשתות העברת סיגנלים בחיידקים
• מערכת התגובה לעקה כללית General stress response
• מערכת התגובה לנזקים ל-The SOS response DNA
• מערכת התגובה לעקת חום The heat-shock response
• מערכת התגובה להרעבה לחומצות אמיניות The stringent response
• Recoding: צורות ביטוי בלתי שגרתיות של הצופן הגנטי
• מודל האופרון בבקרת ביטוי גנים:
• בקרה חיובית ושלילית
• בקרת שיעתוק על ידי אנטי-טרמינציה
• בקרה מרחוק Action at a distance
• מתגים גנטיים
• פרוטיאוליזה כמנגנון בקרה גנטי
• פרוטיאזות תלויות-אנרגיה
• TmRNA ותפקידו בתיוג חלבונים לדגרדציה
• פרוטיאזות כשפרונים מולקולריים
• מולקולות RNA קטנות ותפקידיהם בבקרת ביטוי גנים
• בקרה חיובית ושלילית ברמת התרגום
• גילוי ואפיון מולקולות חדשות בעזרת DNA microarrys
• מערכות העברת סיגנלים
• Two component ststems
• התנהגות קבוצתית של חיידקים
• Quorum sensing in Gram positive and Gram negative bacteria
• התארגנות ”רב תאית” ויצירת ביופילמים
דרישות קדם:
קורסים בגנטיקה כללית, ביוכימיה של חומצות גרעין וביולוגיה מולקולרית ומיקרוביולוגיה.
נוכחות חובה
הרכב ציון:
בחינה 100%
מטלת סיום: בחינה בכתב